Помимо обработки отдельных документов, вы можете выбрать группу файлов с одинаковым водяным знаком и очистить их все разом в Пакетном режиме. Укажите нужные файлы, добавьте их в окно программы, и она проверит каждый документ на наличие водяного знака.
Когда приложение сформирует список доступных для удаления водяных знаков и картинок, отметьте лишние элементы и нажмите Добавить. Добавив все необходимые объекты, нажмите кнопку Далее, и программа сохранит обновленные файлы PDF в указанную папку.